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Le Shen Nong Ben Cao Jing (Traité de Matière Médicale de Shen Nong) a été le premier livre exisant sur les herbes. Il a été compilé dans la dynastie des Han de l'Est. Un autre livre important sur les herbes connus sous le nom du Ben Cao {Matière Médicale) a été compilé pendant la période des Trois Royaumes par Wu Jin, un disciple de Hua Tuo. Ce livre a été déjà perdu dans l'histoire. La comparaison entre le Shen Nong Ben Cao Jing (Traité de Matière Médicale de Shen Nong) et les citations existantes du Ben Cao (Matière Médicale) de Wu Jin dans d'autres livres montre que le Shen Nong Ben Cao Jing (Traité de Matière Médicale de Shen Nong) est une oeuvre intégrale sur les herbes tandis que le Ben Cao (Matière Médicale) de Wu Jin contient des idées de diverses écoles.
La science de la matière médicale s'est rapidement développée après sa création et divers ouvrages consacrés à ce sujet ont été compilés et publiés. Ceux qui sont existants à présent incluent le Ben Cao Jing Zhu Ji (Explication du Classique de Matière Médicale) compilé par Tao Hongjing (environ 452 à 536) à la base de différentes éditions du Shen Nong Ben Cao Jing (Traité de Matière Médicale de Shen Nong). Ce livre contient 730 sortes d'herbes. Il a marqué le contenu du Shen Nong Ben Cao Jing (Traité de Matière Médicale de Shen Nong) avec la couleur rouge et le contenu de l'explication et du supplément avec la couleur noire. Le nombre d'herbes a été doublé dans le livre de Tao Hanging. En outre, il a changé les classes dites supérieures, moyennes et inférieures de la classification des herbes et a utilisé la méthode fréquemment adoptée par d'autres médecins pour classer les herbes selon leur propriété naturelle ou leur source de production. Les essais réalisés dans ce livre ont exercé une grande influence sur les livres compilés par les générations postérieures.
Dans le Ben Cao Jing Zhu Ji (Explication du Classique de Matière Médicale), Tao Hongjing a mentionné que la séparation de la Chine a entravé les études de la pharmacie tandis que l'unification de la Chine a favorisé le développement de la pharmacie. En 657 sous la dynastie des Tang, Su Jing a demandé à l'empereur de recompiler la matière médicale afin de résoudre les problèmes de confusion dans les noms et les descriptions incomplètes des herbes. L'empereur a ordonné à plus de vingt chercheurs, y compris Su Jing, de recompiler la materia medica. En 659, le gouvernement a publié le Xin Xiu Ben Cao (Classique Nouvellement Compilé de Matière Médicale), qui était la première pharmacopée compilée officiellement dans le monde, 883 années plus t?t que la Pharmacopée Neiolonbourge (1542) en Europe.
En comparaison avec le Ben Cao Jing Ji Zhu (Explication du Classique de Matière Médicale), le nombre d'herbes dans le Xin Xiu Ben Cao (Classique Nouvellement Compilé de Matière Médicale) a en outre été augmenté et 114 nouvelles herbes ont été ajoutées à la liste des herbes. Malheureusement les dessins en couleur peints à propos de ces herbes ont été perdues dans l'histoire. En Xin Xiu Ben Cao (Classique Nouvellement Compilé de Matière Médicale), certaines de la matière médicale étrangère ont été enregistrées. Ce qui montre que la communication entre la Chine et d'autres pays dans le domaine de la médecine a été intensifiée dans la dynastie des Tang.
Les empereurs de la dynastie des Song ont prêté une grande attention à la médecine et au cours de soins de santé. Treize ans après la fondation du gouvernement, l'empereur a ordonné à certains ministres et médecins impériaux de travailler ensemble en vue de réviser les livres en matière de la matière médicale. En 973, Kai Bao Xin Xiang Ding Ben Cao (Classique Détaillé Révisé de la Matière Médicale Compilé dans la Période de Kaibao) a été rendue publique par le gouvernement. Zhao Kuangyin, le premier empereur de la dynasty des Song a écrit un avant-props pour le classique. C'était le premier livre sur la matière médicale officiellement publié. Ce livre a été révisé à nouveau un an après sa publication et a enregistré 983 sortes d'herbes, presquel39 herbes ont été nouvellement ajoutées.
En 1057, la cour impériale a créé un bureau chargé de la relecture et de la révision des livres de médecine. Le livre intitulé le Jia You Bu Zhu Shen Nong Ben Cao (Supplément au Classique de Matière Médicale de Shen Nong Compilé dans la Période de jia You), compilé par les médecins et certains ministres, a contenu 1083 sortes d'herbes. En 1061, le livre intitulé le Ben Cao Tu jing (Classique en Illustration de la Matière Médicale) compilé par Su Jing a été accompli. Ce livre a contenu 780 herbes et 933 illustrations sur environ 634 herbes. Il était le premier livre du genre publié en caractères sculptés. Plus tard, Chen Cheng a combiné ces deux livres en une et l'a nommé le Chong Guang Bu Zhu Shen Nong Ben Cao jing Tu Bing (Classique en Illustration de la Matière Médicale) en 1092.
Au cours de la dynastie des Song, les médecins folkloriques ont aussi compilé quelques livres sur la matière médicale. Le Zheng Lci Ben Cao (Etudes Détaillées sur la Matière Médicale) a été compilé par Tang Shenwei qui a pratiqué la médecine dans la province du Sichuan. Ce livre a été réalisé en 1082 et contenait 1558 sortes d'herbes. Chaque herbe a été analysée avec les éléments suivants, le dessin, la discussion, l'indication, l'action, la méthode de transformation et la prescription connexe. Plus tard, ce livre a été officiellement révisé à plusieurs reprises et publié comme la pharmacopée d'Etat. Ce livre a résumé les études réalisées par des médecins dans les dynasties précédentes et a exercé une grande influence sur les générations postérieures. Le Ben Cao Gang Mu {Compendium de la Matière Médicale) compilé par Li Shizhen dans la dynastie des Ming était également fondée sur le Zheng Lei Cao Ben (Etudes Détaillées sur Matière Médi cale)
Dans les dynasties des Jin et des Yuan, il y avait deux écoles d'études, l'une était à compléter et réviser le Shen Nong Ben Cao jing (Traité de Matière Médicale de Shen Nong), et l'autre était à faire des études théoriques sur la matière médicale. Dans la fin de la dynastie des Ming, il est apparu un grand livre sur la matière médicale intitulé le Ben Cao Gang Mu (Compendium de la Matière Médicale) (1578) compilé par Li Shizhen.
Le Ben Cao Gang Mu {Compendium de la Matière Médicale) contenait 1892 sortes d'herbes (374 étaient nouvelles) qui étaient classées en 60 catégories et discutées en 16 chapitres. Ce grand livre contenait également 1109 illustrations et plus de 10000 prescriptions. Li Shizhen a consacré 30 années à compiler ce grand livre.
Dans les dynasties des Ming et des Qing, les cultures d'autres pays ont été progressivement introduites en Chine. Par exemple, l'arachide du continent américain est apparu dans le livre intitulé le Shi Wu Ben Cao (Herbes Comestibles) compilé pendant la période moyenne de la dynastie des Ming. Le Ben Cao Gang Mu Shi Yi (Supplément au Compendium de la Matière Médicale) compilé sous la dynastie des Qing par Zhao Xueming (environ 1719-1805) décrivait certains médicaments de la médecine occidentale, tels que la quinine.